El acervo de arte popular que resguarda el Museo Cabañas se conforma por dos colecciones: la primera, Colección Roberto Montenegro, pertenece al Instituto Nacional de Bellas Artes y se encuentra en comodato en el Museo Cabañas desde 2005, y la segunda, Colección de Artes Populares, perteneciente al museo desde 1983.
La Colección de Arte Popular del Museo Cabañas proviene del acervo atesorado por la Secretaría de Cultura del Estado de Jalisco y cuenta con 425 piezas. En conjunto, las dos colecciones poseen una vasta muestra de las diversas técnicas y materiales que con maestría representan a los artistas populares de nuestro país. Incluyen piezas de barro con sus diversas técnicas como el canelo, bandera, petatillo, betus y vidriado; cestería, talla en piedra y hueso, ebanistería y vidrio soplado. Las obras provienen de todas las regiones del país y datan, aproximadamente, desde finales del siglo XIX, hasta las últimas décadas del siglo XX.La colección Roberto Montenegro, con poco más de mil piezas en su haber, lleva el nombre del artista jalisciense ya que fue él mismo quien la conformó a lo largo de su vida, debido a su interés por considerar los valores artísticos, históricos y sociales de las artes populares en México.