La sala destinada al cine en el Museo Cabañas comenzó actividades en 1983 con la apertura del Instituto Cultural Cabañas. En sus inicios fue sede de las primeras ediciones de la Muestra de Cine Mexicano en Guadalajara, hoy Festival Internacional de Cine en Guadalajara. En el año 2007, dentro del marco del décimo aniversario de la declaratoria del Hospicio Cabañas como Patrimonio de la Humanidad, a la sala se le dio el nombre del cineasta tapatío Guillermo del Toro. A partir del 2019 el Museo Cabañas impulsa la sala de cine como una más de las actividades que oferta, y replantea su programación mediante ciclos en torno a las muestras que exhibe el museo, así como temas de actualidad y películas de arte, con el objetivo de generar un espacio de reflexión, crítica y aprendizaje.